空运：优点是快速、便捷、准时，基本上几天内都可以直达非洲各国主要机场，而且清关速度比较快，适合运输价值高、重量轻、对时效要求比较高的货物。空运的缺点是运费比较贵。此外，由于航空管制与机舱尺寸的限制，空运对于运输货物的品类与尺寸也有一定的限制，存在航空禁运品、敏感货物，在计划空运前需要与航空公司或者货运代理进行确认是否能够承运。
海运：优点是成本低、能进行长距离、大批量货运，比较适合运输大宗商品、工程机械等重量大、体积大、而对运输成本敏感、对时效要求不高的货物。海运的缺点主要主是速度慢，航行风险大。从中国到非洲的海运专线的时效基本在60天左右，如广州到尼日利亚LAGOS时效是55~75天、广州到肯尼亚BAMAKO的时效是60~70天等。所以，选择海运时，需要在成本与时效之间进行综合考量。