工程保证金的弊端：
1、保证金存在被挪用的风险，
2、保证金收取及退还的手续繁琐，退还不及时，使资金效率降低，
3、资金占用量大，且容易造成这些资金的无效沉淀。
保函又称保证书，是指银行、保险公司、担保公司或个人应申请人的请求，向第三方开立的一种书面信用担保凭证。做出担保的单位一定要具有良好的商业信用，例如自然人在银行贷款中的信用贷款，银行依据自然人以往履约行为，社会信用生活等数据给自然人的信用等级做出评级，依照评级给自然人划分一定量的授信额度，这笔额度无需任何抵押，仅仅依据自然人在商业生活中产生的商业信用作为银行贷款的来源。
信贷影响：担保公司在开具保函时不会影响投保企业的银行授信额度，但由于本身规模和实力的限制普遍会设置严格的反担保措施，往往要求债务人以其自有资产、银行存款、有价证券或通过其他担保人等提交反担保，作为担保人出具担保的条件。
保函的主体是保函中保证人向受益人所承担责任的条款。其中主要的就是担保金额。担保金额是保证人责任限度，它通常就是受益人的索偿金额。担保金额不一定是具体的金额，也可以是交易金额或合同金额的一定比例。除非保函中有明确规定，担保金额不因义务的部分履行而减少。