在发生著作权纠纷时，是主张权利的有力武器，作为著作权归属的初步证明，除非有其他足以推翻著作权登记证书内容的相反证据，否则，司法、行政或其他有权机关可以采信著作权登记证书上的记载事项，从而大大降低相关权利人的举证难度。
成功通过版权登记申请，可以有效的保护作者以及其他著作权人的合法权益。如果是未登记的版权作品，通常在产生纠纷之时，权利人往往会出现举证困难等问题，所以各国纷纷鼓励作者对于作品，特别是计算机软件之类的作品的版权进行登记，以对应日后出现纠纷之时更好的保护作者的权利，在司法诉讼中作为一个有效的权利证明。
通过版权登记，可以更好宣传自己的作品，在版权交易过程中，也需要有这样的证明文件，方便签订合同，有利于作品的传播和经济价值的实现。此外，学校、事业单位的个人凭借证书可以获得职称的晋级，获得奖励，政策支持等。
进行版权登记后会得到相应的作品登记证书，可以在版权交易时作为主张权利的证明文件;当遇到被抄袭等版权侵权纠纷时，这就是证明自己的证据。另外，办理软件著作权登记的企业可享受国家各种优惠政策，还是“双软认定”的前提条件。版权可作为技术出资入股、体现企业实力等作用。